På Borisovs bröllopsdag till tronen beräknar pojkarna frukterna av hans regeringstid: den undertryckta pestilensen, de slutförda krigema och skörden. De är förvånade över hur länge Godunov var tvungen att övertyga honom att ta makten, och bara hotet om utkommunikation tvingade honom att göra det. Boris återvänder från katedralen och avser att ta emot ambassadörer. Voeikov tillkännager seger över Siberian Khan. Den engelska ambassadören erbjuder bruden till Tsarevich Fedor; påvlig nuncio - ett avtal om förening av kyrkor; Österrikiska, litauiska, svenska, florentinska ambassadörer ber respektfullt någon om hjälp med pengar eller trupper, som för erkännande av sina ägodelar. De persiska och turkiska ambassadörerna anklagar varandra för att ha intrång i Iberia, den iberiska kungens ambassadör ber om skydd. Tsaren ger ett lämpligt svar till alla, fulla av värdighet och styrka, och beordrar alla att få släppas in i de kungliga kamrarna ("Det finns ingen hinder mellan det ryska folket och tsaren!"). Vänligen ensam segrar Boris och, ihåg prinsens död, beslutar: då det oundvikliga priset för statens storhet. Strax efter, medan han väntade i klostercellen på att Irina skulle klippa håret, lyssnar Boris på rapporterna från Semyon Godunov till Romanovs, som inte är nöjda med avbrottet av St. George's Day; mot Vasily Shuisky, en listig och opålitlig tjänare, men säker på sin styrka vill han inte straffa någon. Irina dyker upp, och Boris, som påminner henne om hans vakillationer på vägen till makten, ber om att rättfärdiga honom och erkänna att Rysslands välstånd är värt den sanningen genom vilken han blev kung. Irina godkänner sitt rike och kräver att han inte glömmer sin skuld och inte förlåter sig själv. Vänster med sina egna, de delar.
I palatset lyssnar barnen till Boris, Fjodor och Xenia till berättelserna om Christian, den danska hertigen, Xenias förlovade - om en hård barndom, om att återvända till domstolen, om strider i Flandern med de spanska trupperna, men när Fedor klagar över hans ledighet, noterar kristna att hans ställning, som tillåter honom att studera styrning under en klok suverän, är mycket mer värdig. Christian berättar hur han älskade Ksenia enligt berättelserna om ambassadörer, köpmän och fångar, som förhärligade tillsammans med Rysslands storhet prinsessens skönhet, intelligens och ödmjukhet. De börjar prata om Boris, och alla är överens om kärlek till tsaren, som glömmer sig själv för statens ära och välbefinnande. Alla tre svär att hjälpa varandra. Christian ber Boris, som gick in, i fall av krig, att låta ryska trupper leda, men tsaren avskräckes av freden som har kommit i många år. Barnen lämnar, och Semyon Godunov, som har kommit, meddelar ett rykte om den underbart räddade prinsen Dimitri. I sina kamrar frågar Tsarina Maria Grigoryevna kontoristen Vlasyev om kristendomen och, oavsett hur Juliet Vlasyev är, ser det ut att det var en känsla av att kungen inte var hans far, och hans äldre bror, som nu regerar, gillar inte honom. Underlåtenhet att löfta från kontoristen att vittna för Boris, hon ringer Dementyevna och med ökande irritation får hon veta att Ksenia satt med sin bror och brudgum, och tsaren välkomnar nya seder. Tsarina som kom till Volokhov klagar över att Boris tog tag i Ksenia för tyskarna utan att fråga henne, och tyskarna, tydligen, slog prinsessan på. Volokhov åtar sig att gudomliga vad som är styrkan hos den kristna och krossa den (”Det finns en sådan rot”). I skogen, i rånarlägret, accepterar Ataman Khlopko nya påfyllning av bönderna, förbannar Boris och avskaffandet av St. George's Day. En Posadsky dyker upp, som utan någon rädsla kräver att befria sina kamrater fångade på Moskva-vägen av en rånarvakt, och rapporterar de sanna nyheterna om Tsarevich Dimitri. Posadsky slår upp Khlop för att åka till Bryansk och där, efter att ha kämrat tsarevichens trupper, få förlåtelse och slåss mot Godunov. Mitka dyker upp och drar två rinnande munkar, Mikhail Povadin och Grishka Otrepyev, som ber att gå med i bomullarmén. När Posadsky, efter att ha roat rånarna genom att slåss med Mitka och beordrat att rulla ut fat vin, plötsligt försvinner, visar det sig att munkarna som gick med honom inte vet vem han är.
Boris tvingas erkänna att uppkomsten av en ny fiende drev honom på en blodig väg. Semyon Godunov, anklagad för att ta reda på vem som gömmer sig bakom namnet Demetrius, säger att han inte visste någonting på bekostnad av tortyr. De söker namnet på Grishka Otrepyev, en flyktig mirakel munk, för att på något sätt döpa om fienden. Boris beordrar att multiplicera spionerna och hitta bevis på Romanovs och dessutom, på grund av den pågående hungern, dela ut skattkammaren till folket och beordra honom att inte lyssna till fablerna om prinsen. Tsarevich Fedor ber att skicka honom till trupperna, Tsarevna Ksenia sörjer förändringen i Boris och hans grymhet; En kristen frågar om Boris är säker på Tsarevichs död och berättar om rykten. Barnen lämnar, uppträder drottningen, full av försiktighet och irritation hos den kristna, och tolkar med barnen om "kungen". Kungen förblir döv mot hennes krav på att skicka den kristna bort. Semyon Godunov rapporterar om förrädarnas snabba framsteg, om överföringen av trupper till dem och om Basmanovs envisa motstånd. Vasily Shuisky erbjuder Boris att gå till trupperna själv eller att skicka en dronningdrottning för att vittna om hans son död. Efter att ha beordrat Shuisky att riva språk till dem som sprider rykten, skickar Boris Dimitry för sin mor. I Fedor Nikitich Romanovs hus dricker pojkar Romanovs, Sitsky, Repnin och Cherkassky för prinsen. Shuisky anländer, rapporterar om Boris ordning, ifrågasätts om hans sökning i Uglich, svarar han vagt. Semyon Godunov med bågskyttar, som har anklagat publiken för att vilja förgifta suveränen med gift, tar alla i förvar och passar Vasily Shuisky för att utföra ett förhör. Boris reflekterade ensam på en uppfylld förutsägelse ("Dödad, men levande"), som kom till Shuisky beordrade att förklara från fronten att han själv hade sett tsarens lik i Uglich. Samtidigt pressar rådgivarna på Christian och förklarar att han bör vägra att gifta sig med Ksenia, att Boris har förrådt sig med rädsla, att Ksenia är dotter till en skurk och en tjänare. Christian, känner den närmaste lätthet, tror på Boris skuld, vet inte vad jag ska fatta beslut om. Ksenia kommer, och han, förvirrad i ord och tankar, talar om den oundvikliga separationen och ringer henne sedan att fly från honom från mördaren. Fjodor, som tyst har gått in, står upp för sin far, de kommer att slåss, Ksenia, gråtande, påminner om ed som har givits varandra. Christian raves, och med tanke på honom som sjuk, leder Ksenia och Fedor honom bort.
På Röda torget lyssnar detektiver på samtal mellan människor som gick från requiemen för Tsarevich Dimitri (Grishka anathemet förklarades där). Detektiver tänker, tolkar tal på ett sätt som passar dem, och tar nästan alla i rad. Vasily Shuisky från avrättningsplatsen håller ett tvetydigt tal om den framåtgående fienden och talar om sökningen i Uglich så att det förblir oklart vem det mördade spädbarnet var. Ungefär denna tid beslutade prinsens mamma som kommer från klostret, nu nunnan Martha, som väntar på Boris och vill hämnas, beslutar att erkänna utmanaren som en son; hon säger att hon inte såg sin döda son, ha tappat känslor, och vid minnesgudstjänsten täckte tårarna hennes ögon. Efter att ha hört talas om Tsarevichs tecken som uppträdde medger han att han på mirakulöst sätt räddades och levde. Tsaritsa Maria Grigoryevna, som vill döma bedrägeri, introducerar Volokhov. Sorgen som grep Martha vid ögonen på mördaren av sin son förråder henne, men hon vägrar att erkänna Demetrius död offentligt. Snart rapporterar läkaren till Boris om försämringen av Christians hälsa och om hans maktlöshet. Semyon Godunov tar med sig ett brev från Dimitry Ioannovich, där Boris är mest deprimerad av den utlovade barmhärtigheten i händelse av en frivillig abdikering av tronen, och därför tjuvens förtroende för universellt stöd. Boris kräver att ta med en korthårig Kleshnin för att vara säker på prinsens död. Hans namn är Christian, och han informerar snart Xenia och Fedor om sin död.
Två väktare, som bär en nattvakt i tronkammaren, gömmer sig i rädsla när den sömnlösa Boris dyker upp. Någon föreställer någons bild på tronen, och när han hittar vakterna skickar han dem för att kontrollera vem som sitter där. Semyon Godunov tar med sig Kleshnin, som bekräftar Demetrius död, påminner om att Borisovs regeringsperiod, förutspådd av magierna, kommer till ett slut, inbjuder honom att omvända sig och lämna till klostret. På morgonen, efter att ha tagit emot från Basmanov som kom med information om en partiell seger över "tjuven", berättar Boris Fedor om behovet av att gifta sig till tronen och om den ed som pojkarna kommer att föras till. Fedor överger tronen, för han är inte säker på att ”tjuven” inte är Demetrius. Boris erbjuder meningsfullt att presentera för Fedor det obestridliga beviset för Tsarevichs död, och han, efter att ha förstått sin fars brott, vägrar i skräck bevis och förklarar att han kommer att acceptera kronan. I matsalen som väntar på Basmanov och tsaren, förbannar pojkarna båda och utbyter nyheter om "prinsen". Basmanov kommer in och klagar över sin olämpliga utkommunikation. Boris dyker upp med barnen. Boris belönar Basmanov. Pojkarna, som noterar Xenias sorg, beklagar henne och undrar vad de ska göra med henne, "när han kommer till kungariket." Boris kräver ett lojalitet till Fedor och godkännandet av denna ed i katedralen, tappar styrka och faller. Med generell förvirring förklarar han att orsaken till hans död inte är gift, utan sorg, testamentar till pojkarna för att hålla en ed, erinrar om att "bara ondska kommer att föds av ondska", och, förklarar Fedor kung, avgår